翻译的进程与转录相似，也分为起始、延伸以及终止三个步骤。翻译起始也一样需要寻觅翻译出发点（起始密码子），结合核糖体小亚基、起始tRNA（tRNAi）以及核糖体大亚基，组装成起始复合物后才能进入延伸阶段。
翻译起始复合物。引自PDB-101文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
起始密码子是AUG，所以起始氨基酸是甲硫氨酸。无非真核的起始tRNA及其携带的甲硫氨酸都是正常的，而原核生物起始氨基酸是甲酰甲硫氨酸（fMet），其tRNA也与正常不同，称为tRNAf。其与甲硫氨酸结合后被甲酰化酶催化甲酰化，供体为甲酰四氢叶酸。文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
另外一方面，真核生物多为单顺反子，即一条mRNA只编码一条肽链，所以只有一个起始密码子。而原核生物由于基因表达采取操纵子模式，所以是多顺反子，有多个起始密码。文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
所以原核生物用一段守旧序列作为起始密码的标志，称为SD序列（Shine-Dalgarno sequence），以其发现者John Shine以及Lynn Dalgarno命名。它位于起始AUG上游约7个碱基处，富含嘌呤，长约4-7个核苷酸。文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
SD序列与16 S rRNA结合。themedicalbiochemistrypage.org文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
在核糖体小亚基中有一段序列与之互补，称为反SD序列（anti-SD sequence，ASD）。所以SD序列还有召募小亚基以及定位翻译出发点（translation initiation site，TIS）的作用。SD序列的突变会降低翻译起始效力。文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
真核生物通常仅有一个起始密码，所以是从帽子向下游扫描来寻觅的，不需要SD序列做标志。无非真核起始密码上游也有一段守旧序列，称为Kozak序列，或Kozak motif，一样以其发现者Marylin Kozak命名。文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
Kozak序列是GCC R CC AUG G，其中R代表嘌呤（A或G），AUG是起始密码。它其实不介入小亚基结合，但仍与翻译效力以及TIS辨认有关。已察看到−3A与真核起始因子eIF2α有互相作用，而+4G与核糖体蛋白S9（rpS9）以及18S rRNA有互相作用。文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
核糖体辨认起始密码子。Trends Biochem Sci. 2019 Dec;44(12):1009-1021.文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
翻译起始进程中也需要多种蛋白因子，称为起始因子（initiation factor）。原核生物中以IF命名，真核称为eIF（eukaryotic IF），注意e为小写。哺乳动物eIF至少有12种，有29种不同的蛋白质组成。最大的eIF复合物是eIF3复合物，包括13个亚基，总质量超过800 kDa。文章源自微观生活（93wg.com）微观生活-https://93wg.com/16144.html
真核生物核糖体亚基及部份翻译起始因子。Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2017 Mar 19; 372(1716): 20
eIF3的主要功能是充当起始复合物组装的支架。它包含PCI、MPN、big等几个部份，可以与40 S小亚基的多个位点结合，环绕整个小亚基，还可与多种起始因子互相作用，召募并调理其精细定位，从而构成多因子复合物（MFC）。
哺乳动物eIF3复合物的亚基形成。RNA Biol. 2018; 15(1): 26–34.
eIF3拥有多种功能。例如，翻译起始需要核糖体解离成40 S以及60 S亚基，而eIF3拥有抗结合活性，可通过与小亚基结合来阻挠其与大亚基从新结合。直到所有筹备工作完成后，eIF3才会解离，以构成80 S起始复合物。eIF1等也有相似作用。
酵母以及兔的40 S亚基与eIF3复合物。Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2017 Mar 19; 372(1716): 20160186
真核翻译起始的典型模式始于三元复合物的构成，由eIF2、携带甲硫氨酸的tRNA以及GTP组成。eIF1，eIF1A以及eIF3增进三元复合物与40S核糖体亚基的结合，构成43 S预起始复合物（pre-initiation complex，PIC）。
这类翻译起始模式也称为帽扫描或帽依赖（cap-dependent）模式。帽辨认蛋白eIF4E结合5&
预起始复合物扫描模型。Nat Rev Mol Cell Biol. 2010 Feb; 11(2): 113–127.
一些蛋白质可以结合eIF4E，因此成为翻译阻遏物。钻研最深刻的翻译阻遏物是哺乳动物eIF4E结合蛋白（4EBP）。如果4EBP被高度磷酸化，就不能与eIF4E结合，从而失去翻译阻遏作用。
在哺乳动物细胞中，mTORC1复合物负责4EBP的磷酸化，在增殖以及细胞生长中起关键作用。一旦mTORC1失活，就会产生4EBP的快速去磷酸化，恢复eIF4E结合能力，从而按捺了帽依赖翻译起始。
参考文献：
1. Hernández G, et al. Conservation and Variability of the AUG Initiation Codon Context in Eukaryotes. Trends Biochem Sci. 2019 Dec;44(12):1009-1021.
2. Gomes-Duarte A, et al. eIF3: a factor for human health and disease. RNA Biol. 2018; 15(1): 26–34.
3. Carissa C. James, et al. Alternative mechanisms of translation initiation: an emerging dynamic regulator of the proteome in health and disease. Life Sci. 2018 Nov 1; 212: 138–144.
4. Aylett CH, et al. Eukaryotic aspects of translation initiation brought into focus. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2017 Mar 19; 372(1716): 20160186.
5. Jackson RJ, et al. The mechanism of eukaryotic translation initiation and principles of its regulation. Nat Rev Mol Cell Biol. 2010 Feb; 11(2): 113–127.
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